یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری

زمینه و هدف: سرطان پروستات ازجمله سرطان‌های شایع میان مردان است که ناهمگونی بسیار بالایی را در ویژگی‌های ژنتیکی و پاتولوژیکی از خود نشان می‌دهد. توضیح روابط تنظیمی بین mRNA و microRNA می‌تواند به شناسایی الگوی تنظیم بیان ژن در سرطان پروستات بدخیم کمک کند. در این مطالعه یک‌پارچه‌سازی شبکه هم‌بیان ژنی و شبکه تنظیمی microRNA در تومور بدخیم پروستات با آنالیز داده‌های بیانی میکرواری بررسی گردید. روش بررسی: در مطالعه حاضر از داده‌های بیانی (ژن و microRNA) بیماران مبتلا به سرطان پروستات، به‌منظور بررسی شبکه اندرکنش ژنی تومور بدخیم پروستات استفاده شد. شبکه هم‌بیان ژنی وزن‌دار برای گروه‌بندی ژن‌ها و یافتن گروه‌های ژنی که همبستگی قابل‌توجهی با متغیر زمان عود بیوشیمیایی بیماری دارند، به کار برده شد. هدف‌های ژنی microRNA‌های با تفاوت بیان از پایگاه‌های داده مبتنی بر پیشگویی و شواهد آزمایشگاهی گردآوری شد. با تلفیق آن با نتایج همبستگی پیرسون داده‌های بیانی ژن و microRNA، شبکه تنظیمی microRNA به دست آمد. یافته‌ها: دوگروه ژنی با همبستگی بالا با زمان عود بیوشیمیایی شناسایی شدند. یکی از این دو در مسیرهای تنظیم و تقسیم چرخه سلولی درگیر شده که جزء مسیرهای مشخصه سرطان است. تلفیق شبکه هم‌بیان با شبکه تنظیمی microRNA نشان داد اولاً این microRNA‌ها، مسیرهایی را هدف قرار می‌دهند که در بدخیم شدن تومور پروستات نقش دارند و دوماً چندین عنصر کلیدی شامل microRNA و ژن را معرفی می‌کنند. نتیجه‌گیری: در مطالعه حاضر، جزئیات بیشتری از اجزای عملکردی کلیدی که باعث بدخیم‌شدن تومور پروستات می‌شوند به دست آمد. این جزئیات ممکن است فرصت‌های جدیدی را برای توسعه روش‌های جایگزین درمانی فراهم کند.